Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3P61158 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms