Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2BFSP57053 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2BFSP57053 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms