Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms