Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms