Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KPNA1P52294 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms