Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLCSP50747 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLCSP50747 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms