Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF6P49848 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF6P49848 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms