Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms