Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT3P49368 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms