Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms