Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC1A2P43004 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms