Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PBX2P40425 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PBX2P40425 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PBX2P40425 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms