Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms