Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID4AP29374 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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