Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB5P28074 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms