Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms