Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms