Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FGFR4P22455 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR4P22455 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms