Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2P22307 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms