Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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