Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD247P20963 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms