Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms