Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCP1P17987 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCP1P17987 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCP1P17987 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCP1P17987 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCP1P17987 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCP1P17987 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCP1P17987 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCP1P17987 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms