Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms