Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms