Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPN1P04843 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPN1P04843 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPN1P04843 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPN1P04843 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPN1P04843 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPN1P04843 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPN1P04843 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPN1P04843 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPN1P04843 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms