Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms