Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC24DO94855 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC24DO94855 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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