Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms