Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms