Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC7A4O43246 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms