Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms