Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms