Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms