Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms