Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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