Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms