Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP11Q9Y3A2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms