Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS4AQ9UN37 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms