Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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