Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms