Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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