Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms