Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms