Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms