Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms