Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms