Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTR3CQ9C0K3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms