Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms