Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms